学院高度重视党建工作，充分发挥党组织的政治核心作用，积极探索民办高校党建工作的新思路、新方法，不断建立健全各级党组织，开展各类党员教育活动。2007年9月，经上级党委批准，中共云南爱因森软件职业学院委员会成立，这是我省民办高校中获批成立的第一个党委。目前，学院党委下设信息工程学院、艺术设计学院、工商管理学院、外语学院、人文学院等8个党支部。2007年10月，我院党委党校成立，迄今为止已举办三期党校培训班，不断在教师和学生中发展新党员。2007-2008年度，我院共发展党员216名。
几年来，学院坚持以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，认真贯彻党的教育方针，牢固树立科学发展观，充分发挥了党组织的政治核心作用，确保了民办高校的社会主义办学方向。2008年 10月8日，省、市、县三级组织部到我院调研，对我院党建工作给予了高度评价，认为我院党建工作在民办院校中起到了示范性作用。